据介绍,如何对抗耐药菌成为科学界面临的巨大难题,而噬菌体合成生物研究为解决这一难题提供了新的思路和方法。
该研究团队相关负责人表示,噬菌体通常具有较小的基因组,其中还有很多的“冗余基因”,导致基因组内没有空余的位置插入“基因武器”。同时,这些“冗余基因”有可能会编码一些对人体有害的蛋白。
该研究团队设想,如果能将噬菌体基因组内的“冗余基因”删除,得到一个精简的安全的“底盘噬菌体”,同时获得足够的位置插入功能基《五福彩app下载送15元》因。
为实现上述设想,研究团队面临三大挑战,其中包括如何高通量快速地鉴定和删除噬菌体的“冗余基因”;如何同时获得具有更高杀菌效率的突变噬菌体;以及逐个删除这些基因需要巨大的工作量。
据悉,在细菌中,有一种对抗噬菌体的防御系统叫做crispr-cas系统,当噬菌体侵染到含有这一系统的细菌时,噬菌体的基因组会被“切割”。对此,研究人员可以在细菌中通过人工合成的方式设计一套crispr-cas系统,当噬菌体基因组进入含有这一系统的细菌内部时,某个特定的基因将会被删除。
基于crispr的原理,马迎飞团队开发了一种自上而下的全基因组简化方法,称为“基于crispr-cas9的迭代噬菌体基因组简化方法”(crispr/cas9-based iterative phage genome reduction, cipgr)。
在cipgr过程中,研究团队只需要获得噬菌体基因组序列,就能够将该方法轻松推广至其他野生型噬菌体。这些精简的噬菌体能够整合更多的基因元件以增强噬菌体的功能,在噬菌体治疗中具有巨大的应用潜力。
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本报记者 毕锐 【编辑:刘璋 】